Program Studi Magister Agroekoteknologi (PSMAE) dibentuk berdasarkan pada perlunya peningkatan sumber daya manusia Indonesia di wilayah Jambi dan sekitarnya yang berkompeten dalam pengembangan teknologi pertanian berkelanjutan. PSMAE secara resmi dibuka pada tanggal 28 Januari 2014 berdasarkan surat dari Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi no 85/E.E2/DT/2014 dan dilanjutkan dengan Surat izin penyelenggaraan dari Direktorat  Jenderal Pendidikan Tinggi tanggal 19 Mei 2014 melalui Surat Keputusan No.  107/E/O/2014 tanggal 19 Mei 2014.